Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf34Q99KR6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms