Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms