Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TirapQ99JY1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TirapQ99JY1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TirapQ99JY1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TirapQ99JY1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms