Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms