Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spef1Q99JL1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spef1Q99JL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms