Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms