Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd1Q99J36 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms