Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms