Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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