Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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