Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek8Q91ZR4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms