Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm2Q91YD4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm2Q91YD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms