Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lims2Q91XD2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lims2Q91XD2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms