Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Setd3Q91WC0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Setd3Q91WC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms