Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms