Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nsmce2Q91VT1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsmce2Q91VT1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms