Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NifkQ91VE6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms