Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf4Q8VE97 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms