Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smg8Q8VE18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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