Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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