Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc36Q8VBW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms