Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gipc3Q8R5M0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms