Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg10Q8R1P4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms