Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CipcQ8R0W1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms