Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2f4Q8R0K9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f4Q8R0K9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms