Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms