Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk5rap2Q8K389 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms