Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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Rbm17Q8JZX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Rbm17Q8JZX4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Rbm17Q8JZX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Rbm17Q8JZX4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm17Q8JZX4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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Rbm17Q8JZX4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm17Q8JZX4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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