Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Afg3l2Q8JZQ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms