Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZM6

Tifab, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TifabQ8JZM6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TifabQ8JZM6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifabQ8JZM6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms