Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1bQ8JZL7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms