Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh4a1Q8CHT0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh4a1Q8CHT0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms