Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Setd1bQ8CFT2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms