Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf17Q8CFA7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf17Q8CFA7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms