Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef8Q8CE24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef8Q8CE24 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms