Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms