Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms