Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo43Q8CDI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms