Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E4f1Q8CCE9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms