Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms