Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms