Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5K5

Uncharacterized protein CXorf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5K5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5K5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5K5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5K5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms