Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms