Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfrp1Q8C4U3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms