Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms