Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccser1Q8C0C4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccser1Q8C0C4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccser1Q8C0C4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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