Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZG5

Rrnad1, Protein RRNAD1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrnad1Q8BZG5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrnad1Q8BZG5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrnad1Q8BZG5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms