Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ythdf3Q8BYK6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ythdf3Q8BYK6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms