Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh12Q8BYK4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms