Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms